آیت الله قاضی در اولین دوره مدیریت حوزه علمیه قم به ریاست محمد مؤمن قمی، معاونت اداری حوزه را بر عهده داشت و در واقع سنگ بنای همه تشکیلات مدیریت امروزی حوزه، به دست مهدی قاضی بنیان نهاده شد.

 

شورای مدیریت حوزه علمیه قم، نهادی برای سازماندهی امور آموزشی و اداری حوزه علمیه قم است.

ضرورت اصلاح حوزه پس از پیروزی انقلاب اسلامی، موجب شد امام‌خمینی در سال ۱۳۵۸ از اعضای جامعه مدرسین حوزه علمیه قم بخواهد هرچه زودتر طرحی برای اداره حوزه بریزند. پیشنهاد تشکیل شورای مدیریت حوزۀ علمیه به امام‌خمینی در همین جهت بود. اعضای پیشنهادی اولیه برای اداره حوزه، سه‌نماینده از طرف امام‌خمینی، سه‌نماینده از طرف گلپایگانی و سه‌نفر از طرف جامعه مدرسین بودند.

برخی از مهم‌ترین فعالیت‌های شورا، عبارت بود از: تعیین آئین‌نامه برای پذیرش طلاب، سازماندهی طلاب مبتدی، تشکیل پرونده تحصیلی، برقراری آزمون‌، تشکیل دفتر مدیریت، تقویت حوزه‌های شهرستان‌ها، اعزام مدرس برای تدریس به مدارس علمیه شهرستان‌ها. شورا در ساماندهی حوزه از نمایندگان طلاب بهره می‌گرفت.

امام‌خمینی در جمع اعضای شورای مرکزی مدیریت حوزه، بر استقامت در راه، سیاست تدریجی، مدارا، اخلاق در مدیریت و مشورت با مراجع تأکید کرد.

پس از رحلت امام‌خمینی، شورای مدیریت حوزه به شورای عالی حوزه علمیه قم تبدیل شد.